Министерство здравоохранения Пензенской области.Взаимодействие с Минздравом Пензенской области осуществляется в рамках системы подготовки кадров для регионального здравоохранения.

ГАУЗ ПО "Пензенская стоматологическая поликлиника"  ведущее медицинское учреждение Пензенской области, оказывающее стоматологическую помощь в амбулаторных условиях населению Пензенской области. Основная база для прохождения практик студентами факультета стоматологии. Главный врач Блащук Елена Александровна.

ГБУЗ Пензенская областная клиническая больница им. Н.Н.Бурденко - ведущее учреждение здравоохранения Пензенской области. Основная клиническая база клинических кафедр медицинского института ПГУ. Главный врач Фролова Ирина Владимировна. База кафедры "Челюстно-лицевая хирургия" (и.о. зав. кафедрой к.м.н., доцент А.В. Нестеров, заместитель главного врача по хирургической помощи) факультета стоматологии.

ГБУЗ Пензенская областная офтальмологическая больница - ведущее учреждение Пензенской области по оказанию высококвалифицированной медицинской помощи пациентам с патологией органа зрения. Главный врач к.м.н. Галеев Рашит Сагитович. База курса офтальмологии кафедры "Челюстно-лицевая хирургия" факультета стоматологии.

Центр доклинических исследований группы компаний "МедИнж" - высокотехнологичная база для проведения научных экспериментальных исследований на животных.